Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx3O70492 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx3O70492 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx3O70492 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx3O70492 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx3O70492 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx3O70492 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx3O70492 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx3O70492 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx3O70492 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx3O70492 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx3O70492 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx3O70492 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx3O70492 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx3O70492 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx3O70492 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx3O70492 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx3O70492 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx3O70492 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx3O70492 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx3O70492 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx3O70492 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx3O70492 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx3O70492 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx3O70492 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Snx3O70492 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx3O70492 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx3O70492 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx3O70492 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Snx3O70492 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx3O70492 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx3O70492 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Snx3O70492 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx3O70492 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snx3O70492 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx3O70492 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx3O70492 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx3O70492 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx3O70492 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx3O70492 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx3O70492 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx3O70492 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx3O70492 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snx3O70492 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx3O70492 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx3O70492 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx3O70492 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx3O70492 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx3O70492 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx3O70492 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx3O70492 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx3O70492 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx3O70492 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx3O70492 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx3O70492 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx3O70492 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx3O70492 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx3O70492 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx3O70492 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx3O70492 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx3O70492 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx3O70492 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx3O70492 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx3O70492 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx3O70492 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx3O70492 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx3O70492 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx3O70492 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx3O70492 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx3O70492 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx3O70492 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx3O70492 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx3O70492 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx3O70492 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx3O70492 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms