Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aff2O55112 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aff2O55112 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aff2O55112 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aff2O55112 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Aff2O55112 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aff2O55112 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aff2O55112 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aff2O55112 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aff2O55112 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aff2O55112 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aff2O55112 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aff2O55112 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aff2O55112 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aff2O55112 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aff2O55112 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aff2O55112 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aff2O55112 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aff2O55112 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Aff2O55112 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aff2O55112 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aff2O55112 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aff2O55112 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aff2O55112 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aff2O55112 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aff2O55112 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Aff2O55112 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Aff2O55112 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aff2O55112 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aff2O55112 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aff2O55112 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aff2O55112 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Aff2O55112 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Aff2O55112 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aff2O55112 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aff2O55112 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aff2O55112 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aff2O55112 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aff2O55112 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aff2O55112 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Aff2O55112 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aff2O55112 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aff2O55112 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Aff2O55112 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Aff2O55112 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aff2O55112 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aff2O55112 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Aff2O55112 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Aff2O55112 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aff2O55112 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aff2O55112 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aff2O55112 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aff2O55112 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aff2O55112 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Aff2O55112 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aff2O55112 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aff2O55112 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aff2O55112 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Aff2O55112 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aff2O55112 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aff2O55112 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aff2O55112 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aff2O55112 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aff2O55112 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aff2O55112 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aff2O55112 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aff2O55112 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aff2O55112 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aff2O55112 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff2O55112 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aff2O55112 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aff2O55112 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aff2O55112 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aff2O55112 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Aff2O55112 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aff2O55112 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aff2O55112 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aff2O55112 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aff2O55112 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aff2O55112 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Aff2O55112 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aff2O55112 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms