Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Syngr2O55101 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Syngr2O55101 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Syngr2O55101 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Syngr2O55101 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Syngr2O55101 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Syngr2O55101 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Syngr2O55101 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Syngr2O55101 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Syngr2O55101 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Syngr2O55101 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Syngr2O55101 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Syngr2O55101 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Syngr2O55101 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Syngr2O55101 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Syngr2O55101 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Syngr2O55101 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Syngr2O55101 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Syngr2O55101 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Syngr2O55101 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Syngr2O55101 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Syngr2O55101 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Syngr2O55101 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Syngr2O55101 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Syngr2O55101 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Syngr2O55101 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Syngr2O55101 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Syngr2O55101 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Syngr2O55101 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Syngr2O55101 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,39■■□□□ 1,02
Syngr2O55101 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Syngr2O55101 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Syngr2O55101 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Syngr2O55101 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,35■■□□□ 1,01
Syngr2O55101 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Syngr2O55101 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Syngr2O55101 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Syngr2O55101 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Syngr2O55101 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Syngr2O55101 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Syngr2O55101 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Syngr2O55101 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Syngr2O55101 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Syngr2O55101 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Syngr2O55101 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Syngr2O55101 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Syngr2O55101 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Syngr2O55101 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Syngr2O55101 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Syngr2O55101 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Syngr2O55101 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Syngr2O55101 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Syngr2O55101 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Syngr2O55101 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Syngr2O55101 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Syngr2O55101 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Syngr2O55101 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms