Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr2O55101 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngr2O55101 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngr2O55101 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syngr2O55101 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syngr2O55101 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngr2O55101 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syngr2O55101 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngr2O55101 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syngr2O55101 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syngr2O55101 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syngr2O55101 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syngr2O55101 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syngr2O55101 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syngr2O55101 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr2O55101 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Syngr2O55101 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syngr2O55101 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syngr2O55101 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syngr2O55101 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr2O55101 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr2O55101 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngr2O55101 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngr2O55101 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr2O55101 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr2O55101 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr2O55101 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr2O55101 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr2O55101 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr2O55101 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngr2O55101 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngr2O55101 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr2O55101 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr2O55101 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr2O55101 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr2O55101 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr2O55101 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr2O55101 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr2O55101 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr2O55101 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr2O55101 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syngr2O55101 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syngr2O55101 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syngr2O55101 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syngr2O55101 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syngr2O55101 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngr2O55101 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syngr2O55101 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngr2O55101 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syngr2O55101 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngr2O55101 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngr2O55101 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr2O55101 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngr2O55101 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngr2O55101 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syngr2O55101 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syngr2O55101 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr2O55101 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syngr2O55101 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syngr2O55101 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms