Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SlkO54988 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SlkO54988 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SlkO54988 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SlkO54988 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SlkO54988 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SlkO54988 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SlkO54988 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SlkO54988 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SlkO54988 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SlkO54988 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SlkO54988 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SlkO54988 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SlkO54988 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SlkO54988 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SlkO54988 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SlkO54988 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SlkO54988 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SlkO54988 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SlkO54988 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SlkO54988 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SlkO54988 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SlkO54988 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SlkO54988 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SlkO54988 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SlkO54988 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SlkO54988 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SlkO54988 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SlkO54988 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SlkO54988 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SlkO54988 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SlkO54988 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SlkO54988 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SlkO54988 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SlkO54988 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SlkO54988 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SlkO54988 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SlkO54988 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SlkO54988 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SlkO54988 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SlkO54988 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SlkO54988 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SlkO54988 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SlkO54988 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SlkO54988 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SlkO54988 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SlkO54988 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SlkO54988 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SlkO54988 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SlkO54988 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SlkO54988 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SlkO54988 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SlkO54988 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SlkO54988 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SlkO54988 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SlkO54988 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SlkO54988 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SlkO54988 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SlkO54988 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SlkO54988 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SlkO54988 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SlkO54988 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SlkO54988 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SlkO54988 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SlkO54988 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SlkO54988 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SlkO54988 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SlkO54988 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
SlkO54988 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SlkO54988 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SlkO54988 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SlkO54988 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SlkO54988 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SlkO54988 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SlkO54988 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SlkO54988 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SlkO54988 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SlkO54988 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SlkO54988 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SlkO54988 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SlkO54988 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SlkO54988 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SlkO54988 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SlkO54988 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SlkO54988 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SlkO54988 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SlkO54988 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SlkO54988 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SlkO54988 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SlkO54988 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SlkO54988 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SlkO54988 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SlkO54988 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SlkO54988 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SlkO54988 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SlkO54988 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SlkO54988 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SlkO54988 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SlkO54988 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SlkO54988 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms