Protein–RNA interactions for Protein: O54792

Hes2, Transcription factor HES-2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes2O54792 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hes2O54792 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hes2O54792 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hes2O54792 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hes2O54792 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hes2O54792 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hes2O54792 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hes2O54792 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hes2O54792 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hes2O54792 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hes2O54792 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hes2O54792 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hes2O54792 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Hes2O54792 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hes2O54792 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hes2O54792 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hes2O54792 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hes2O54792 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Hes2O54792 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hes2O54792 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hes2O54792 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hes2O54792 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hes2O54792 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hes2O54792 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hes2O54792 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hes2O54792 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hes2O54792 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hes2O54792 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hes2O54792 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hes2O54792 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hes2O54792 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hes2O54792 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hes2O54792 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hes2O54792 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Hes2O54792 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hes2O54792 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hes2O54792 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hes2O54792 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hes2O54792 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hes2O54792 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hes2O54792 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hes2O54792 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hes2O54792 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Hes2O54792 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hes2O54792 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Hes2O54792 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hes2O54792 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hes2O54792 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hes2O54792 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hes2O54792 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hes2O54792 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hes2O54792 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hes2O54792 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hes2O54792 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hes2O54792 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hes2O54792 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hes2O54792 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hes2O54792 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hes2O54792 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hes2O54792 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hes2O54792 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hes2O54792 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hes2O54792 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hes2O54792 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Hes2O54792 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hes2O54792 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hes2O54792 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hes2O54792 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hes2O54792 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hes2O54792 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hes2O54792 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hes2O54792 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hes2O54792 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hes2O54792 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hes2O54792 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hes2O54792 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hes2O54792 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hes2O54792 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms