Protein–RNA interactions for Protein: O54714

Pias3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias3O54714 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pias3O54714 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pias3O54714 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pias3O54714 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pias3O54714 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pias3O54714 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pias3O54714 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pias3O54714 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pias3O54714 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pias3O54714 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pias3O54714 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pias3O54714 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pias3O54714 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pias3O54714 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pias3O54714 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pias3O54714 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pias3O54714 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pias3O54714 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pias3O54714 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pias3O54714 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pias3O54714 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pias3O54714 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pias3O54714 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pias3O54714 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pias3O54714 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pias3O54714 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pias3O54714 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pias3O54714 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pias3O54714 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pias3O54714 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pias3O54714 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pias3O54714 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pias3O54714 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pias3O54714 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pias3O54714 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pias3O54714 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pias3O54714 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pias3O54714 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pias3O54714 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pias3O54714 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pias3O54714 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pias3O54714 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pias3O54714 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pias3O54714 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pias3O54714 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pias3O54714 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pias3O54714 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pias3O54714 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pias3O54714 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pias3O54714 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pias3O54714 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pias3O54714 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pias3O54714 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pias3O54714 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pias3O54714 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pias3O54714 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pias3O54714 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pias3O54714 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pias3O54714 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pias3O54714 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pias3O54714 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pias3O54714 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pias3O54714 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pias3O54714 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pias3O54714 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pias3O54714 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pias3O54714 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pias3O54714 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pias3O54714 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pias3O54714 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pias3O54714 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pias3O54714 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pias3O54714 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pias3O54714 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms