Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnnd2O35927 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnnd2O35927 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnd2O35927 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd2O35927 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd2O35927 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd2O35927 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctnnd2O35927 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd2O35927 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd2O35927 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd2O35927 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnnd2O35927 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnnd2O35927 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnnd2O35927 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnd2O35927 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnd2O35927 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd2O35927 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd2O35927 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd2O35927 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnnd2O35927 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnd2O35927 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnnd2O35927 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnnd2O35927 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnnd2O35927 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctnnd2O35927 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd2O35927 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd2O35927 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd2O35927 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnd2O35927 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnd2O35927 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctnnd2O35927 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctnnd2O35927 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctnnd2O35927 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctnnd2O35927 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnnd2O35927 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnnd2O35927 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnnd2O35927 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctnnd2O35927 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnnd2O35927 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctnnd2O35927 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnd2O35927 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnnd2O35927 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnnd2O35927 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnnd2O35927 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnnd2O35927 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnnd2O35927 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnnd2O35927 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnnd2O35927 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctnnd2O35927 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctnnd2O35927 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ctnnd2O35927 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnnd2O35927 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnnd2O35927 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnnd2O35927 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnnd2O35927 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnnd2O35927 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctnnd2O35927 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnnd2O35927 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnnd2O35927 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd2O35927 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnnd2O35927 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnnd2O35927 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnnd2O35927 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnd2O35927 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnnd2O35927 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnnd2O35927 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnd2O35927 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnd2O35927 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd2O35927 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd2O35927 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnnd2O35927 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnd2O35927 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd2O35927 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnd2O35927 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnd2O35927 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnd2O35927 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnd2O35927 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnd2O35927 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnd2O35927 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnd2O35927 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnd2O35927 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnd2O35927 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnd2O35927 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnd2O35927 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnnd2O35927 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnd2O35927 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnd2O35927 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnd2O35927 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnnd2O35927 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnnd2O35927 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnd2O35927 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnd2O35927 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnd2O35927 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms