Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Phox2bO35690 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phox2bO35690 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phox2bO35690 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phox2bO35690 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phox2bO35690 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Phox2bO35690 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phox2bO35690 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phox2bO35690 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phox2bO35690 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Phox2bO35690 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phox2bO35690 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phox2bO35690 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phox2bO35690 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phox2bO35690 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phox2bO35690 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phox2bO35690 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Phox2bO35690 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phox2bO35690 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phox2bO35690 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phox2bO35690 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phox2bO35690 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phox2bO35690 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phox2bO35690 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phox2bO35690 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phox2bO35690 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phox2bO35690 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Phox2bO35690 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Phox2bO35690 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Phox2bO35690 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Phox2bO35690 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Phox2bO35690 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Phox2bO35690 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phox2bO35690 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phox2bO35690 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phox2bO35690 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phox2bO35690 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phox2bO35690 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phox2bO35690 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phox2bO35690 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Phox2bO35690 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phox2bO35690 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phox2bO35690 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Phox2bO35690 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Phox2bO35690 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phox2bO35690 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phox2bO35690 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phox2bO35690 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phox2bO35690 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phox2bO35690 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phox2bO35690 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Phox2bO35690 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phox2bO35690 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Phox2bO35690 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Phox2bO35690 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phox2bO35690 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Phox2bO35690 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phox2bO35690 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Phox2bO35690 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phox2bO35690 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phox2bO35690 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phox2bO35690 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phox2bO35690 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phox2bO35690 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phox2bO35690 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phox2bO35690 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phox2bO35690 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Phox2bO35690 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phox2bO35690 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phox2bO35690 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phox2bO35690 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Phox2bO35690 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Phox2bO35690 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms