Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,1■■■■□ 3,21
NmiO35309 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
NmiO35309 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35,06■■■■□ 3,2
NmiO35309 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,2
NmiO35309 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
NmiO35309 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
NmiO35309 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
NmiO35309 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
NmiO35309 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
NmiO35309 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
NmiO35309 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,79■■■■□ 3,16
NmiO35309 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,78■■■■□ 3,16
NmiO35309 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
NmiO35309 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
NmiO35309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
NmiO35309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
NmiO35309 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
NmiO35309 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
NmiO35309 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
NmiO35309 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
NmiO35309 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
NmiO35309 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,53■■■■□ 3,12
NmiO35309 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
NmiO35309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
NmiO35309 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,5■■■■□ 3,11
NmiO35309 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
NmiO35309 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
NmiO35309 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
NmiO35309 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,4■■■■□ 3,1
NmiO35309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
NmiO35309 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
NmiO35309 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
NmiO35309 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
NmiO35309 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
NmiO35309 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,16■■■■□ 3,06
NmiO35309 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
NmiO35309 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
NmiO35309 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
NmiO35309 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
NmiO35309 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
NmiO35309 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
NmiO35309 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
NmiO35309 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
NmiO35309 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
NmiO35309 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
NmiO35309 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
NmiO35309 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
NmiO35309 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
NmiO35309 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
NmiO35309 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
NmiO35309 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
NmiO35309 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,93■■■■□ 3,02
NmiO35309 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
NmiO35309 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,91■■■■□ 3,02
NmiO35309 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
NmiO35309 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
NmiO35309 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
NmiO35309 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
NmiO35309 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
NmiO35309 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
NmiO35309 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
NmiO35309 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
NmiO35309 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
NmiO35309 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
NmiO35309 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
NmiO35309 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
NmiO35309 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
NmiO35309 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
NmiO35309 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
NmiO35309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
NmiO35309 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
NmiO35309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
NmiO35309 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
NmiO35309 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
NmiO35309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
NmiO35309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
NmiO35309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
NmiO35309 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
NmiO35309 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
NmiO35309 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
NmiO35309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
NmiO35309 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
NmiO35309 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
NmiO35309 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
NmiO35309 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
NmiO35309 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
NmiO35309 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
NmiO35309 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
NmiO35309 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
NmiO35309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
NmiO35309 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
NmiO35309 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
NmiO35309 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
NmiO35309 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
NmiO35309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,1■■■□□ 2,89
NmiO35309 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
NmiO35309 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
NmiO35309 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
NmiO35309 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
NmiO35309 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms