Protein–RNA interactions for Protein: O19443

H2-M10.1, Histocompatibility 2, M region locus 10.1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.1O19443 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-M10.1O19443 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-M10.1O19443 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M10.1O19443 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M10.1O19443 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M10.1O19443 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M10.1O19443 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M10.1O19443 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M10.1O19443 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M10.1O19443 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-M10.1O19443 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M10.1O19443 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M10.1O19443 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M10.1O19443 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M10.1O19443 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M10.1O19443 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M10.1O19443 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M10.1O19443 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M10.1O19443 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M10.1O19443 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M10.1O19443 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M10.1O19443 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M10.1O19443 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M10.1O19443 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M10.1O19443 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M10.1O19443 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.1O19443 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M10.1O19443 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M10.1O19443 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M10.1O19443 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.1O19443 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M10.1O19443 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.1O19443 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M10.1O19443 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M10.1O19443 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M10.1O19443 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M10.1O19443 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M10.1O19443 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M10.1O19443 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M10.1O19443 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M10.1O19443 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M10.1O19443 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M10.1O19443 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M10.1O19443 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.1O19443 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.1O19443 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.1O19443 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.1O19443 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.1O19443 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.1O19443 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.1O19443 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.1O19443 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.1O19443 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M10.1O19443 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M10.1O19443 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M10.1O19443 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M10.1O19443 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M10.1O19443 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M10.1O19443 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms