Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,58■■■■■ 4,73
WrnO09053 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,58■■■■■ 4,73
WrnO09053 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,54■■■■■ 4,72
WrnO09053 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,43■■■■■ 4,7
WrnO09053 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,41■■■■■ 4,7
WrnO09053 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,41■■■■■ 4,7
WrnO09053 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,39■■■■■ 4,7
WrnO09053 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
WrnO09053 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,68
WrnO09053 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,28■■■■■ 4,68
WrnO09053 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44,16■■■■■ 4,66
WrnO09053 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,12■■■■■ 4,65
WrnO09053 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
WrnO09053 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,1■■■■■ 4,65
WrnO09053 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,07■■■■■ 4,65
WrnO09053 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,01■■■■■ 4,64
WrnO09053 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC43,98■■■■■ 4,63
WrnO09053 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43,97■■■■■ 4,63
WrnO09053 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43,93■■■■■ 4,62
WrnO09053 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43,91■■■■■ 4,62
WrnO09053 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,86■■■■■ 4,61
WrnO09053 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43,84■■■■■ 4,61
WrnO09053 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,83■■■■■ 4,61
WrnO09053 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43,82■■■■■ 4,61
WrnO09053 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,8■■■■■ 4,6
WrnO09053 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,79■■■■■ 4,6
WrnO09053 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43,76■■■■■ 4,6
WrnO09053 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43,74■■■■■ 4,59
WrnO09053 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
WrnO09053 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
WrnO09053 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
WrnO09053 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43,65■■■■■ 4,58
WrnO09053 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
WrnO09053 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43,62■■■■■ 4,57
WrnO09053 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,62■■■■■ 4,57
WrnO09053 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,59■■■■■ 4,57
WrnO09053 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43,57■■■■■ 4,57
WrnO09053 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43,5■■■■■ 4,55
WrnO09053 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,47■■■■■ 4,55
WrnO09053 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
WrnO09053 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
WrnO09053 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43,39■■■■■ 4,54
WrnO09053 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
WrnO09053 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,33■■■■■ 4,53
WrnO09053 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43,32■■■■■ 4,53
WrnO09053 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,52
WrnO09053 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,31■■■■■ 4,52
WrnO09053 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,29■■■■■ 4,52
WrnO09053 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,28■■■■■ 4,52
WrnO09053 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
WrnO09053 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
WrnO09053 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43,26■■■■■ 4,52
WrnO09053 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
WrnO09053 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
WrnO09053 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
WrnO09053 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
WrnO09053 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
WrnO09053 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
WrnO09053 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,07■■■■■ 4,48
WrnO09053 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
WrnO09053 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
WrnO09053 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
WrnO09053 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42,89■■■■■ 4,46
WrnO09053 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC42,8■■■■■ 4,44
WrnO09053 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,8■■■■■ 4,44
WrnO09053 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
WrnO09053 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
WrnO09053 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
WrnO09053 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,68■■■■■ 4,42
WrnO09053 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
WrnO09053 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,65■■■■■ 4,42
WrnO09053 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42,64■■■■■ 4,42
WrnO09053 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42,64■■■■■ 4,42
WrnO09053 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,41
WrnO09053 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
WrnO09053 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42,62■■■■■ 4,41
WrnO09053 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
WrnO09053 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
WrnO09053 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
WrnO09053 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42,56■■■■■ 4,4
WrnO09053 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
WrnO09053 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42,55■■■■■ 4,4
WrnO09053 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42,52■■■■■ 4,4
WrnO09053 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42,48■■■■■ 4,39
WrnO09053 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42,45■■■■■ 4,39
WrnO09053 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
WrnO09053 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
WrnO09053 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
WrnO09053 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42,43■■■■■ 4,38
WrnO09053 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42,42■■■■■ 4,38
WrnO09053 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42,37■■■■■ 4,37
WrnO09053 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
WrnO09053 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42,36■■■■■ 4,37
WrnO09053 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,35■■■■■ 4,37
WrnO09053 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
WrnO09053 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42,32■■■■■ 4,37
WrnO09053 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42,29■■■■■ 4,36
WrnO09053 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42,24■■■■■ 4,35
WrnO09053 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,23■■■■■ 4,35
WrnO09053 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms