Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gfra2O08842 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gfra2O08842 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gfra2O08842 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gfra2O08842 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gfra2O08842 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gfra2O08842 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gfra2O08842 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gfra2O08842 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gfra2O08842 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gfra2O08842 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gfra2O08842 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gfra2O08842 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gfra2O08842 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gfra2O08842 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gfra2O08842 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gfra2O08842 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gfra2O08842 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gfra2O08842 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gfra2O08842 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gfra2O08842 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gfra2O08842 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gfra2O08842 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gfra2O08842 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gfra2O08842 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gfra2O08842 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gfra2O08842 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gfra2O08842 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gfra2O08842 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gfra2O08842 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gfra2O08842 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gfra2O08842 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gfra2O08842 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gfra2O08842 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gfra2O08842 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gfra2O08842 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gfra2O08842 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gfra2O08842 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gfra2O08842 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gfra2O08842 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gfra2O08842 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gfra2O08842 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gfra2O08842 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gfra2O08842 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gfra2O08842 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gfra2O08842 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra2O08842 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gfra2O08842 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gfra2O08842 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gfra2O08842 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gfra2O08842 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gfra2O08842 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gfra2O08842 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gfra2O08842 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gfra2O08842 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gfra2O08842 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gfra2O08842 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gfra2O08842 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gfra2O08842 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gfra2O08842 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gfra2O08842 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gfra2O08842 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gfra2O08842 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gfra2O08842 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gfra2O08842 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gfra2O08842 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gfra2O08842 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gfra2O08842 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gfra2O08842 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gfra2O08842 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gfra2O08842 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gfra2O08842 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gfra2O08842 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gfra2O08842 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gfra2O08842 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gfra2O08842 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gfra2O08842 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gfra2O08842 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gfra2O08842 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gfra2O08842 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms