Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MsmbO08540 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MsmbO08540 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MsmbO08540 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsmbO08540 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
MsmbO08540 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MsmbO08540 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsmbO08540 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsmbO08540 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsmbO08540 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsmbO08540 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MsmbO08540 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MsmbO08540 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MsmbO08540 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MsmbO08540 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MsmbO08540 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MsmbO08540 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MsmbO08540 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MsmbO08540 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MsmbO08540 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MsmbO08540 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MsmbO08540 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MsmbO08540 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MsmbO08540 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MsmbO08540 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MsmbO08540 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MsmbO08540 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MsmbO08540 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MsmbO08540 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MsmbO08540 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MsmbO08540 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MsmbO08540 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MsmbO08540 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MsmbO08540 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MsmbO08540 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MsmbO08540 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MsmbO08540 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MsmbO08540 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MsmbO08540 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MsmbO08540 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MsmbO08540 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MsmbO08540 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MsmbO08540 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MsmbO08540 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MsmbO08540 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MsmbO08540 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MsmbO08540 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MsmbO08540 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MsmbO08540 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MsmbO08540 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MsmbO08540 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MsmbO08540 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MsmbO08540 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MsmbO08540 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MsmbO08540 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MsmbO08540 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MsmbO08540 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MsmbO08540 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MsmbO08540 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MsmbO08540 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MsmbO08540 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MsmbO08540 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MsmbO08540 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MsmbO08540 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MsmbO08540 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MsmbO08540 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MsmbO08540 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MsmbO08540 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MsmbO08540 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MsmbO08540 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MsmbO08540 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MsmbO08540 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MsmbO08540 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MsmbO08540 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MsmbO08540 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MsmbO08540 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MsmbO08540 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MsmbO08540 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsmbO08540 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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