Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm9602J3QPD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm9602J3QPD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9602J3QPD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm9602J3QPD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm9602J3QPD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9602J3QPD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm9602J3QPD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm9602J3QPD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm9602J3QPD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm9602J3QPD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9602J3QPD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9602J3QPD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm9602J3QPD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm9602J3QPD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm9602J3QPD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm9602J3QPD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm9602J3QPD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm9602J3QPD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm9602J3QPD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm9602J3QPD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm9602J3QPD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm9602J3QPD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm9602J3QPD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm9602J3QPD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm9602J3QPD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm9602J3QPD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm9602J3QPD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm9602J3QPD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm9602J3QPD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm9602J3QPD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm9602J3QPD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm9602J3QPD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm9602J3QPD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm9602J3QPD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm9602J3QPD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm9602J3QPD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm9602J3QPD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm9602J3QPD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm9602J3QPD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm9602J3QPD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm9602J3QPD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm9602J3QPD5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm9602J3QPD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm9602J3QPD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms