Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm933J3QPC1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm933J3QPC1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm933J3QPC1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm933J3QPC1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm933J3QPC1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm933J3QPC1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm933J3QPC1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm933J3QPC1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm933J3QPC1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm933J3QPC1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm933J3QPC1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm933J3QPC1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm933J3QPC1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm933J3QPC1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm933J3QPC1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm933J3QPC1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm933J3QPC1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm933J3QPC1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm933J3QPC1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm933J3QPC1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm933J3QPC1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm933J3QPC1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm933J3QPC1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm933J3QPC1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm933J3QPC1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm933J3QPC1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm933J3QPC1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm933J3QPC1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm933J3QPC1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm933J3QPC1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm933J3QPC1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm933J3QPC1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm933J3QPC1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm933J3QPC1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm933J3QPC1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm933J3QPC1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm933J3QPC1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm933J3QPC1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm933J3QPC1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm933J3QPC1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm933J3QPC1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm933J3QPC1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm933J3QPC1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm933J3QPC1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm933J3QPC1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm933J3QPC1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm933J3QPC1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm933J3QPC1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm933J3QPC1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm933J3QPC1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms