Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX6

Krtap22-2, Keratin-associated protein 22-2, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap22-2J3QNX6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap22-2J3QNX6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap22-2J3QNX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krtap22-2J3QNX6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap22-2J3QNX6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Krtap22-2J3QNX6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krtap22-2J3QNX6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap22-2J3QNX6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap22-2J3QNX6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap22-2J3QNX6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Krtap22-2J3QNX6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap22-2J3QNX6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap22-2J3QNX6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Krtap22-2J3QNX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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