Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20873J3QMQ9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm20873J3QMQ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm20873J3QMQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20873J3QMQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20873J3QMQ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20873J3QMQ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20873J3QMQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20873J3QMQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20873J3QMQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20873J3QMQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20873J3QMQ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20873J3QMQ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20873J3QMQ9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20873J3QMQ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20873J3QMQ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20873J3QMQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20873J3QMQ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20873J3QMQ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20873J3QMQ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20873J3QMQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20873J3QMQ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20873J3QMQ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20873J3QMQ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20873J3QMQ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20873J3QMQ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20873J3QMQ9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20873J3QMQ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20873J3QMQ9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20873J3QMQ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20873J3QMQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20873J3QMQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20873J3QMQ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20873J3QMQ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm20873J3QMQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20873J3QMQ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20873J3QMQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20873J3QMQ9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20873J3QMQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20873J3QMQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20873J3QMQ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20873J3QMQ9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20873J3QMQ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20873J3QMQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20873J3QMQ9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20873J3QMQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20873J3QMQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20873J3QMQ9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20873J3QMQ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20873J3QMQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20873J3QMQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20873J3QMQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm20873J3QMQ9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20873J3QMQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20873J3QMQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20873J3QMQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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