Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK6

Aldh3b3, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b3J3QMK6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh3b3J3QMK6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aldh3b3J3QMK6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aldh3b3J3QMK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh3b3J3QMK6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh3b3J3QMK6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aldh3b3J3QMK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh3b3J3QMK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh3b3J3QMK6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Aldh3b3J3QMK6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aldh3b3J3QMK6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aldh3b3J3QMK6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh3b3J3QMK6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh3b3J3QMK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh3b3J3QMK6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh3b3J3QMK6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh3b3J3QMK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh3b3J3QMK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh3b3J3QMK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh3b3J3QMK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh3b3J3QMK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh3b3J3QMK6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh3b3J3QMK6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b3J3QMK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh3b3J3QMK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh3b3J3QMK6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh3b3J3QMK6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh3b3J3QMK6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh3b3J3QMK6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh3b3J3QMK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh3b3J3QMK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh3b3J3QMK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh3b3J3QMK6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh3b3J3QMK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh3b3J3QMK6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh3b3J3QMK6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh3b3J3QMK6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b3J3QMK6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh3b3J3QMK6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh3b3J3QMK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh3b3J3QMK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b3J3QMK6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3b3J3QMK6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3b3J3QMK6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh3b3J3QMK6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh3b3J3QMK6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3b3J3QMK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh3b3J3QMK6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3b3J3QMK6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b3J3QMK6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b3J3QMK6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3b3J3QMK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh3b3J3QMK6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh3b3J3QMK6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3b3J3QMK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh3b3J3QMK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3b3J3QMK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b3J3QMK6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh3b3J3QMK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh3b3J3QMK6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh3b3J3QMK6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh3b3J3QMK6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh3b3J3QMK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b3J3QMK6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms