Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20830J3KML6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20830J3KML6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20830J3KML6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20830J3KML6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20830J3KML6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20830J3KML6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20830J3KML6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20830J3KML6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20830J3KML6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20830J3KML6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20830J3KML6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20830J3KML6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20830J3KML6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20830J3KML6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20830J3KML6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20830J3KML6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20830J3KML6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20830J3KML6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20830J3KML6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20830J3KML6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20830J3KML6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20830J3KML6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20830J3KML6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20830J3KML6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20830J3KML6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm20830J3KML6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20830J3KML6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20830J3KML6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20830J3KML6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20830J3KML6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20830J3KML6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20830J3KML6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20830J3KML6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20830J3KML6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20830J3KML6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20830J3KML6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20830J3KML6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20830J3KML6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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