Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20517G3UVU6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20517G3UVU6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20517G3UVU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20517G3UVU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20517G3UVU6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20517G3UVU6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20517G3UVU6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20517G3UVU6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20517G3UVU6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20517G3UVU6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20517G3UVU6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20517G3UVU6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm20517G3UVU6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20517G3UVU6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20517G3UVU6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20517G3UVU6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20517G3UVU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20517G3UVU6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20517G3UVU6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20517G3UVU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20517G3UVU6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20517G3UVU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20517G3UVU6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20517G3UVU6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20517G3UVU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20517G3UVU6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20517G3UVU6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20517G3UVU6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20517G3UVU6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20517G3UVU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20517G3UVU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20517G3UVU6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20517G3UVU6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20517G3UVU6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20517G3UVU6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20517G3UVU6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20517G3UVU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20517G3UVU6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20517G3UVU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20517G3UVU6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20517G3UVU6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20517G3UVU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20517G3UVU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20517G3UVU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms