Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp9yF8VPU6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp9yF8VPU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp9yF8VPU6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp9yF8VPU6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp9yF8VPU6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp9yF8VPU6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp9yF8VPU6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp9yF8VPU6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp9yF8VPU6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp9yF8VPU6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp9yF8VPU6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp9yF8VPU6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp9yF8VPU6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp9yF8VPU6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp9yF8VPU6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp9yF8VPU6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp9yF8VPU6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp9yF8VPU6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp9yF8VPU6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp9yF8VPU6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp9yF8VPU6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp9yF8VPU6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp9yF8VPU6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp9yF8VPU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp9yF8VPU6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp9yF8VPU6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp9yF8VPU6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp9yF8VPU6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp9yF8VPU6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp9yF8VPU6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp9yF8VPU6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp9yF8VPU6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp9yF8VPU6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp9yF8VPU6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp9yF8VPU6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp9yF8VPU6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp9yF8VPU6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp9yF8VPU6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp9yF8VPU6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp9yF8VPU6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp9yF8VPU6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp9yF8VPU6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp9yF8VPU6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp9yF8VPU6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp9yF8VPU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp9yF8VPU6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp9yF8VPU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp9yF8VPU6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp9yF8VPU6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp9yF8VPU6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp9yF8VPU6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp9yF8VPU6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp9yF8VPU6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp9yF8VPU6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp9yF8VPU6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp9yF8VPU6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms