Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8444F6XS56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8444F6XS56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm8444F6XS56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm8444F6XS56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm8444F6XS56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm8444F6XS56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm8444F6XS56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm8444F6XS56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm8444F6XS56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm8444F6XS56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm8444F6XS56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm8444F6XS56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm8444F6XS56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm8444F6XS56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm8444F6XS56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm8444F6XS56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm8444F6XS56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm8444F6XS56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm8444F6XS56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm8444F6XS56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm8444F6XS56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8444F6XS56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8444F6XS56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8444F6XS56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm8444F6XS56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8444F6XS56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8444F6XS56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8444F6XS56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8444F6XS56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm8444F6XS56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm8444F6XS56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm8444F6XS56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm8444F6XS56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm8444F6XS56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm8444F6XS56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm8444F6XS56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm8444F6XS56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm8444F6XS56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm8444F6XS56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm8444F6XS56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm8444F6XS56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm8444F6XS56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm8444F6XS56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm8444F6XS56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm8444F6XS56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm8444F6XS56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm8444F6XS56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm8444F6XS56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm8444F6XS56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm8444F6XS56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm8444F6XS56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm8444F6XS56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm8444F6XS56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm8444F6XS56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm8444F6XS56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm8444F6XS56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm8444F6XS56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm8444F6XS56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm8444F6XS56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm8444F6XS56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm8444F6XS56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm8444F6XS56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm8444F6XS56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm8444F6XS56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm8444F6XS56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm8444F6XS56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm8444F6XS56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm8444F6XS56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm8444F6XS56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm8444F6XS56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm8444F6XS56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm8444F6XS56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm8444F6XS56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm8444F6XS56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm8444F6XS56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm8444F6XS56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm8444F6XS56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm8444F6XS56 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm8444F6XS56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm8444F6XS56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms