Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC067074F6RXI4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC067074F6RXI4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC067074F6RXI4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC067074F6RXI4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC067074F6RXI4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC067074F6RXI4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC067074F6RXI4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC067074F6RXI4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC067074F6RXI4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC067074F6RXI4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC067074F6RXI4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC067074F6RXI4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC067074F6RXI4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BC067074F6RXI4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC067074F6RXI4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC067074F6RXI4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC067074F6RXI4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC067074F6RXI4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC067074F6RXI4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BC067074F6RXI4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC067074F6RXI4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BC067074F6RXI4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC067074F6RXI4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BC067074F6RXI4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC067074F6RXI4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC067074F6RXI4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC067074F6RXI4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC067074F6RXI4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BC067074F6RXI4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC067074F6RXI4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC067074F6RXI4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC067074F6RXI4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC067074F6RXI4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC067074F6RXI4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC067074F6RXI4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BC067074F6RXI4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC067074F6RXI4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BC067074F6RXI4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC067074F6RXI4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC067074F6RXI4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC067074F6RXI4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC067074F6RXI4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC067074F6RXI4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC067074F6RXI4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC067074F6RXI4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BC067074F6RXI4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC067074F6RXI4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC067074F6RXI4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BC067074F6RXI4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BC067074F6RXI4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BC067074F6RXI4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BC067074F6RXI4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BC067074F6RXI4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC067074F6RXI4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BC067074F6RXI4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BC067074F6RXI4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC067074F6RXI4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC067074F6RXI4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC067074F6RXI4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC067074F6RXI4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC067074F6RXI4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC067074F6RXI4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC067074F6RXI4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC067074F6RXI4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC067074F6RXI4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BC067074F6RXI4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BC067074F6RXI4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC067074F6RXI4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BC067074F6RXI4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC067074F6RXI4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BC067074F6RXI4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BC067074F6RXI4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC067074F6RXI4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC067074F6RXI4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC067074F6RXI4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC067074F6RXI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC067074F6RXI4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BC067074F6RXI4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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