Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ccdc85cE9Q6B2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Ccdc85cE9Q6B2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ccdc85cE9Q6B2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Ccdc85cE9Q6B2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
Ccdc85cE9Q6B2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Ccdc85cE9Q6B2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Ccdc85cE9Q6B2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Ccdc85cE9Q6B2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Ccdc85cE9Q6B2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Ccdc85cE9Q6B2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Ccdc85cE9Q6B2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Ccdc85cE9Q6B2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ccdc85cE9Q6B2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Ccdc85cE9Q6B2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ccdc85cE9Q6B2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Ccdc85cE9Q6B2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Ccdc85cE9Q6B2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Ccdc85cE9Q6B2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Ccdc85cE9Q6B2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Ccdc85cE9Q6B2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Ccdc85cE9Q6B2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Ccdc85cE9Q6B2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Ccdc85cE9Q6B2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Ccdc85cE9Q6B2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Ccdc85cE9Q6B2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35,25■■■■□ 3,23
Ccdc85cE9Q6B2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Ccdc85cE9Q6B2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Ccdc85cE9Q6B2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Ccdc85cE9Q6B2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Ccdc85cE9Q6B2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Ccdc85cE9Q6B2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Ccdc85cE9Q6B2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Ccdc85cE9Q6B2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ccdc85cE9Q6B2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Ccdc85cE9Q6B2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Ccdc85cE9Q6B2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Ccdc85cE9Q6B2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3,19
Ccdc85cE9Q6B2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Ccdc85cE9Q6B2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Ccdc85cE9Q6B2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Ccdc85cE9Q6B2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Ccdc85cE9Q6B2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Ccdc85cE9Q6B2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Ccdc85cE9Q6B2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Ccdc85cE9Q6B2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Ccdc85cE9Q6B2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Ccdc85cE9Q6B2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Ccdc85cE9Q6B2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Ccdc85cE9Q6B2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Ccdc85cE9Q6B2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,57■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,55■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ccdc85cE9Q6B2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Ccdc85cE9Q6B2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Ccdc85cE9Q6B2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Ccdc85cE9Q6B2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Ccdc85cE9Q6B2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Ccdc85cE9Q6B2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms