Protein–RNA interactions for Protein: E9Q422

A530032D15Rik, RIKEN cDNA A530032D15Rik gene, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530032D15RikE9Q422 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A530032D15RikE9Q422 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
A530032D15RikE9Q422 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A530032D15RikE9Q422 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A530032D15RikE9Q422 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A530032D15RikE9Q422 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A530032D15RikE9Q422 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A530032D15RikE9Q422 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A530032D15RikE9Q422 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A530032D15RikE9Q422 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A530032D15RikE9Q422 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A530032D15RikE9Q422 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A530032D15RikE9Q422 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A530032D15RikE9Q422 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A530032D15RikE9Q422 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A530032D15RikE9Q422 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A530032D15RikE9Q422 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A530032D15RikE9Q422 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
A530032D15RikE9Q422 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A530032D15RikE9Q422 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A530032D15RikE9Q422 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A530032D15RikE9Q422 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A530032D15RikE9Q422 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A530032D15RikE9Q422 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A530032D15RikE9Q422 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A530032D15RikE9Q422 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A530032D15RikE9Q422 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A530032D15RikE9Q422 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A530032D15RikE9Q422 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A530032D15RikE9Q422 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A530032D15RikE9Q422 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A530032D15RikE9Q422 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A530032D15RikE9Q422 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A530032D15RikE9Q422 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A530032D15RikE9Q422 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A530032D15RikE9Q422 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A530032D15RikE9Q422 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A530032D15RikE9Q422 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A530032D15RikE9Q422 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A530032D15RikE9Q422 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A530032D15RikE9Q422 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A530032D15RikE9Q422 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A530032D15RikE9Q422 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A530032D15RikE9Q422 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A530032D15RikE9Q422 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A530032D15RikE9Q422 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A530032D15RikE9Q422 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A530032D15RikE9Q422 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A530032D15RikE9Q422 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A530032D15RikE9Q422 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms