Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dchs1E9PVD3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dchs1E9PVD3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dchs1E9PVD3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dchs1E9PVD3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dchs1E9PVD3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dchs1E9PVD3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dchs1E9PVD3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dchs1E9PVD3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dchs1E9PVD3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dchs1E9PVD3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dchs1E9PVD3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dchs1E9PVD3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dchs1E9PVD3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dchs1E9PVD3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dchs1E9PVD3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dchs1E9PVD3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dchs1E9PVD3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Dchs1E9PVD3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dchs1E9PVD3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dchs1E9PVD3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dchs1E9PVD3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dchs1E9PVD3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dchs1E9PVD3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dchs1E9PVD3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dchs1E9PVD3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dchs1E9PVD3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dchs1E9PVD3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dchs1E9PVD3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dchs1E9PVD3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dchs1E9PVD3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dchs1E9PVD3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dchs1E9PVD3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dchs1E9PVD3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dchs1E9PVD3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dchs1E9PVD3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dchs1E9PVD3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dchs1E9PVD3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dchs1E9PVD3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dchs1E9PVD3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dchs1E9PVD3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dchs1E9PVD3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dchs1E9PVD3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dchs1E9PVD3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dchs1E9PVD3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dchs1E9PVD3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dchs1E9PVD3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dchs1E9PVD3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dchs1E9PVD3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dchs1E9PVD3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dchs1E9PVD3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dchs1E9PVD3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dchs1E9PVD3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dchs1E9PVD3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dchs1E9PVD3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dchs1E9PVD3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dchs1E9PVD3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dchs1E9PVD3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dchs1E9PVD3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dchs1E9PVD3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dchs1E9PVD3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Dchs1E9PVD3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dchs1E9PVD3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dchs1E9PVD3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dchs1E9PVD3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dchs1E9PVD3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dchs1E9PVD3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dchs1E9PVD3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dchs1E9PVD3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dchs1E9PVD3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms