Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ifit3bE9PV48 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Ifit3bE9PV48 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifit3bE9PV48 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifit3bE9PV48 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit3bE9PV48 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit3bE9PV48 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit3bE9PV48 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifit3bE9PV48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifit3bE9PV48 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifit3bE9PV48 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ifit3bE9PV48 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit3bE9PV48 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifit3bE9PV48 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit3bE9PV48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifit3bE9PV48 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifit3bE9PV48 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifit3bE9PV48 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifit3bE9PV48 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifit3bE9PV48 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifit3bE9PV48 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifit3bE9PV48 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifit3bE9PV48 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifit3bE9PV48 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifit3bE9PV48 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifit3bE9PV48 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifit3bE9PV48 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifit3bE9PV48 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ifit3bE9PV48 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifit3bE9PV48 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifit3bE9PV48 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifit3bE9PV48 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ifit3bE9PV48 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifit3bE9PV48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifit3bE9PV48 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifit3bE9PV48 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifit3bE9PV48 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifit3bE9PV48 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifit3bE9PV48 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifit3bE9PV48 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifit3bE9PV48 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifit3bE9PV48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifit3bE9PV48 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifit3bE9PV48 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifit3bE9PV48 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifit3bE9PV48 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifit3bE9PV48 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifit3bE9PV48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifit3bE9PV48 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifit3bE9PV48 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifit3bE9PV48 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifit3bE9PV48 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifit3bE9PV48 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifit3bE9PV48 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifit3bE9PV48 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifit3bE9PV48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit3bE9PV48 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit3bE9PV48 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifit3bE9PV48 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifit3bE9PV48 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifit3bE9PV48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit3bE9PV48 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit3bE9PV48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifit3bE9PV48 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifit3bE9PV48 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit3bE9PV48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit3bE9PV48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit3bE9PV48 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit3bE9PV48 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3bE9PV48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms