Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Syde2E9PUP1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,34
Syde2E9PUP1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Syde2E9PUP1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Syde2E9PUP1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Syde2E9PUP1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Syde2E9PUP1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Syde2E9PUP1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Syde2E9PUP1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,76■■■■□ 3,31
Syde2E9PUP1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Syde2E9PUP1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
Syde2E9PUP1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Syde2E9PUP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,68■■■■□ 3,3
Syde2E9PUP1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Syde2E9PUP1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Syde2E9PUP1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Syde2E9PUP1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Syde2E9PUP1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Syde2E9PUP1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Syde2E9PUP1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Syde2E9PUP1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Syde2E9PUP1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Syde2E9PUP1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Syde2E9PUP1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Syde2E9PUP1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Syde2E9PUP1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Syde2E9PUP1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Syde2E9PUP1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Syde2E9PUP1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Syde2E9PUP1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Syde2E9PUP1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Syde2E9PUP1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Syde2E9PUP1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Syde2E9PUP1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Syde2E9PUP1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Syde2E9PUP1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Syde2E9PUP1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Syde2E9PUP1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Syde2E9PUP1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Syde2E9PUP1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Syde2E9PUP1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Syde2E9PUP1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
Syde2E9PUP1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
Syde2E9PUP1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Syde2E9PUP1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Syde2E9PUP1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Syde2E9PUP1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Syde2E9PUP1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Syde2E9PUP1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Syde2E9PUP1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Syde2E9PUP1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Syde2E9PUP1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Syde2E9PUP1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Syde2E9PUP1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Syde2E9PUP1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Syde2E9PUP1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Syde2E9PUP1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Syde2E9PUP1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Syde2E9PUP1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Syde2E9PUP1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Syde2E9PUP1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Syde2E9PUP1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Syde2E9PUP1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Syde2E9PUP1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Syde2E9PUP1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Syde2E9PUP1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Syde2E9PUP1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Syde2E9PUP1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,4■■■■□ 3,1
Syde2E9PUP1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Syde2E9PUP1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Syde2E9PUP1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Syde2E9PUP1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Syde2E9PUP1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Syde2E9PUP1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Syde2E9PUP1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Syde2E9PUP1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
Syde2E9PUP1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Syde2E9PUP1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Syde2E9PUP1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Syde2E9PUP1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Syde2E9PUP1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Syde2E9PUP1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Syde2E9PUP1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
Syde2E9PUP1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Syde2E9PUP1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Syde2E9PUP1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Syde2E9PUP1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Syde2E9PUP1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Syde2E9PUP1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Syde2E9PUP1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Syde2E9PUP1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Syde2E9PUP1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Syde2E9PUP1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33,93■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms