Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl3E0CZ16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Klhl3E0CZ16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klhl3E0CZ16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klhl3E0CZ16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Klhl3E0CZ16 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klhl3E0CZ16 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Klhl3E0CZ16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klhl3E0CZ16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Klhl3E0CZ16 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Klhl3E0CZ16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Klhl3E0CZ16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Klhl3E0CZ16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Klhl3E0CZ16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Klhl3E0CZ16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Klhl3E0CZ16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klhl3E0CZ16 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Klhl3E0CZ16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klhl3E0CZ16 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Klhl3E0CZ16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Klhl3E0CZ16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klhl3E0CZ16 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl3E0CZ16 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl3E0CZ16 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl3E0CZ16 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klhl3E0CZ16 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl3E0CZ16 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl3E0CZ16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl3E0CZ16 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl3E0CZ16 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl3E0CZ16 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl3E0CZ16 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl3E0CZ16 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl3E0CZ16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl3E0CZ16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl3E0CZ16 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl3E0CZ16 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Klhl3E0CZ16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl3E0CZ16 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl3E0CZ16 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl3E0CZ16 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl3E0CZ16 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl3E0CZ16 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl3E0CZ16 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl3E0CZ16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl3E0CZ16 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl3E0CZ16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl3E0CZ16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl3E0CZ16 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl3E0CZ16 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl3E0CZ16 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl3E0CZ16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl3E0CZ16 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl3E0CZ16 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl3E0CZ16 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klhl3E0CZ16 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl3E0CZ16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl3E0CZ16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klhl3E0CZ16 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl3E0CZ16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl3E0CZ16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms