Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930595D18RikD3Z642 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930595D18RikD3Z642 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
4930595D18RikD3Z642 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930595D18RikD3Z642 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930595D18RikD3Z642 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930595D18RikD3Z642 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930595D18RikD3Z642 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930595D18RikD3Z642 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4930595D18RikD3Z642 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930595D18RikD3Z642 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930595D18RikD3Z642 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930595D18RikD3Z642 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930595D18RikD3Z642 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930595D18RikD3Z642 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930595D18RikD3Z642 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930595D18RikD3Z642 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930595D18RikD3Z642 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930595D18RikD3Z642 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
4930595D18RikD3Z642 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930595D18RikD3Z642 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930595D18RikD3Z642 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930595D18RikD3Z642 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930595D18RikD3Z642 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930595D18RikD3Z642 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4930595D18RikD3Z642 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930595D18RikD3Z642 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930595D18RikD3Z642 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930595D18RikD3Z642 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930595D18RikD3Z642 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930595D18RikD3Z642 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
4930595D18RikD3Z642 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930595D18RikD3Z642 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930595D18RikD3Z642 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930595D18RikD3Z642 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930595D18RikD3Z642 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930595D18RikD3Z642 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930595D18RikD3Z642 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930595D18RikD3Z642 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930595D18RikD3Z642 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930595D18RikD3Z642 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930595D18RikD3Z642 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930595D18RikD3Z642 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930595D18RikD3Z642 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930595D18RikD3Z642 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930595D18RikD3Z642 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930595D18RikD3Z642 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4930595D18RikD3Z642 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
4930595D18RikD3Z642 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930595D18RikD3Z642 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930595D18RikD3Z642 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930595D18RikD3Z642 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930595D18RikD3Z642 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930595D18RikD3Z642 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930595D18RikD3Z642 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930595D18RikD3Z642 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930595D18RikD3Z642 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930595D18RikD3Z642 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930595D18RikD3Z642 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930595D18RikD3Z642 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930595D18RikD3Z642 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930595D18RikD3Z642 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
4930595D18RikD3Z642 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930595D18RikD3Z642 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930595D18RikD3Z642 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930595D18RikD3Z642 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930595D18RikD3Z642 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms