Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Fam46aD3Z5S8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Fam46aD3Z5S8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Fam46aD3Z5S8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Fam46aD3Z5S8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Fam46aD3Z5S8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Fam46aD3Z5S8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Fam46aD3Z5S8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Fam46aD3Z5S8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Fam46aD3Z5S8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Fam46aD3Z5S8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Fam46aD3Z5S8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Fam46aD3Z5S8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Fam46aD3Z5S8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Fam46aD3Z5S8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Fam46aD3Z5S8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Fam46aD3Z5S8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Fam46aD3Z5S8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Fam46aD3Z5S8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Fam46aD3Z5S8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Fam46aD3Z5S8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Fam46aD3Z5S8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Fam46aD3Z5S8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Fam46aD3Z5S8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Fam46aD3Z5S8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Fam46aD3Z5S8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Fam46aD3Z5S8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Fam46aD3Z5S8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Fam46aD3Z5S8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Fam46aD3Z5S8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Fam46aD3Z5S8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,72
Fam46aD3Z5S8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Fam46aD3Z5S8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Fam46aD3Z5S8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Fam46aD3Z5S8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Fam46aD3Z5S8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Fam46aD3Z5S8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Fam46aD3Z5S8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Fam46aD3Z5S8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Fam46aD3Z5S8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Fam46aD3Z5S8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Fam46aD3Z5S8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Fam46aD3Z5S8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Fam46aD3Z5S8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Fam46aD3Z5S8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Fam46aD3Z5S8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Fam46aD3Z5S8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Fam46aD3Z5S8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Fam46aD3Z5S8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Fam46aD3Z5S8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Fam46aD3Z5S8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Fam46aD3Z5S8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Fam46aD3Z5S8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Fam46aD3Z5S8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Fam46aD3Z5S8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Fam46aD3Z5S8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Fam46aD3Z5S8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Fam46aD3Z5S8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Fam46aD3Z5S8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Fam46aD3Z5S8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Fam46aD3Z5S8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Fam46aD3Z5S8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Fam46aD3Z5S8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Fam46aD3Z5S8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fam46aD3Z5S8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fam46aD3Z5S8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Fam46aD3Z5S8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Fam46aD3Z5S8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Fam46aD3Z5S8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Fam46aD3Z5S8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Fam46aD3Z5S8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Fam46aD3Z5S8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Fam46aD3Z5S8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Fam46aD3Z5S8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Fam46aD3Z5S8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Fam46aD3Z5S8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Fam46aD3Z5S8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Fam46aD3Z5S8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Fam46aD3Z5S8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Fam46aD3Z5S8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms