Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Gm4871D3Z0W7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Gm4871D3Z0W7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gm4871D3Z0W7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gm4871D3Z0W7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Gm4871D3Z0W7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Gm4871D3Z0W7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Gm4871D3Z0W7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Gm4871D3Z0W7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Gm4871D3Z0W7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Gm4871D3Z0W7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Gm4871D3Z0W7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Gm4871D3Z0W7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Gm4871D3Z0W7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Gm4871D3Z0W7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Gm4871D3Z0W7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gm4871D3Z0W7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gm4871D3Z0W7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Gm4871D3Z0W7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Gm4871D3Z0W7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Gm4871D3Z0W7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Gm4871D3Z0W7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Gm4871D3Z0W7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Gm4871D3Z0W7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Gm4871D3Z0W7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,81
Gm4871D3Z0W7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gm4871D3Z0W7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gm4871D3Z0W7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Gm4871D3Z0W7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Gm4871D3Z0W7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Gm4871D3Z0W7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Gm4871D3Z0W7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gm4871D3Z0W7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gm4871D3Z0W7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gm4871D3Z0W7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Gm4871D3Z0W7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gm4871D3Z0W7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Gm4871D3Z0W7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gm4871D3Z0W7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gm4871D3Z0W7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gm4871D3Z0W7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Gm4871D3Z0W7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gm4871D3Z0W7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gm4871D3Z0W7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Gm4871D3Z0W7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gm4871D3Z0W7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gm4871D3Z0W7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Gm4871D3Z0W7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gm4871D3Z0W7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Gm4871D3Z0W7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Gm4871D3Z0W7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gm4871D3Z0W7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Gm4871D3Z0W7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Gm4871D3Z0W7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gm4871D3Z0W7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Gm4871D3Z0W7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Gm4871D3Z0W7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gm4871D3Z0W7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gm4871D3Z0W7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gm4871D3Z0W7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gm4871D3Z0W7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm4871D3Z0W7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm4871D3Z0W7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gm4871D3Z0W7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Gm4871D3Z0W7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gm4871D3Z0W7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Gm4871D3Z0W7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Gm4871D3Z0W7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm4871D3Z0W7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gm4871D3Z0W7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gm4871D3Z0W7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gm4871D3Z0W7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Gm4871D3Z0W7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gm4871D3Z0W7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gm4871D3Z0W7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gm4871D3Z0W7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm4871D3Z0W7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gm4871D3Z0W7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,3 ms