Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf217D3YYI7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf217D3YYI7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf217D3YYI7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf217D3YYI7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf217D3YYI7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf217D3YYI7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf217D3YYI7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf217D3YYI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf217D3YYI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf217D3YYI7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf217D3YYI7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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