Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CrnnD3YUU6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrnnD3YUU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CrnnD3YUU6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrnnD3YUU6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrnnD3YUU6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrnnD3YUU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrnnD3YUU6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrnnD3YUU6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrnnD3YUU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrnnD3YUU6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrnnD3YUU6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrnnD3YUU6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrnnD3YUU6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrnnD3YUU6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CrnnD3YUU6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrnnD3YUU6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrnnD3YUU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrnnD3YUU6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrnnD3YUU6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrnnD3YUU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrnnD3YUU6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrnnD3YUU6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrnnD3YUU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrnnD3YUU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrnnD3YUU6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrnnD3YUU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrnnD3YUU6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrnnD3YUU6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrnnD3YUU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrnnD3YUU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrnnD3YUU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrnnD3YUU6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrnnD3YUU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrnnD3YUU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CrnnD3YUU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CrnnD3YUU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CrnnD3YUU6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrnnD3YUU6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CrnnD3YUU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CrnnD3YUU6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CrnnD3YUU6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CrnnD3YUU6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CrnnD3YUU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CrnnD3YUU6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CrnnD3YUU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CrnnD3YUU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CrnnD3YUU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CrnnD3YUU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CrnnD3YUU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CrnnD3YUU6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CrnnD3YUU6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CrnnD3YUU6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CrnnD3YUU6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrnnD3YUU6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrnnD3YUU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrnnD3YUU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrnnD3YUU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrnnD3YUU6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrnnD3YUU6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CrnnD3YUU6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrnnD3YUU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrnnD3YUU6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms