Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700015F17RikD3YUK8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700015F17RikD3YUK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700015F17RikD3YUK8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700015F17RikD3YUK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700015F17RikD3YUK8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700015F17RikD3YUK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700015F17RikD3YUK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700015F17RikD3YUK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700015F17RikD3YUK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700015F17RikD3YUK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700015F17RikD3YUK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700015F17RikD3YUK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700015F17RikD3YUK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700015F17RikD3YUK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700015F17RikD3YUK8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700015F17RikD3YUK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700015F17RikD3YUK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700015F17RikD3YUK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700015F17RikD3YUK8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700015F17RikD3YUK8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700015F17RikD3YUK8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700015F17RikD3YUK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700015F17RikD3YUK8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700015F17RikD3YUK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700015F17RikD3YUK8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700015F17RikD3YUK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700015F17RikD3YUK8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700015F17RikD3YUK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700015F17RikD3YUK8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1700015F17RikD3YUK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700015F17RikD3YUK8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700015F17RikD3YUK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700015F17RikD3YUK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700015F17RikD3YUK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1700015F17RikD3YUK8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
1700015F17RikD3YUK8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700015F17RikD3YUK8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700015F17RikD3YUK8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700015F17RikD3YUK8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700015F17RikD3YUK8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700015F17RikD3YUK8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700015F17RikD3YUK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700015F17RikD3YUK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700015F17RikD3YUK8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700015F17RikD3YUK8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700015F17RikD3YUK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700015F17RikD3YUK8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700015F17RikD3YUK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms