Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Mbd5B1AYB6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Mbd5B1AYB6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Mbd5B1AYB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Mbd5B1AYB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Mbd5B1AYB6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Mbd5B1AYB6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Mbd5B1AYB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Mbd5B1AYB6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Mbd5B1AYB6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Mbd5B1AYB6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Mbd5B1AYB6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
Mbd5B1AYB6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Mbd5B1AYB6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
Mbd5B1AYB6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Mbd5B1AYB6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Mbd5B1AYB6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Mbd5B1AYB6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Mbd5B1AYB6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Mbd5B1AYB6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Mbd5B1AYB6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Mbd5B1AYB6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Mbd5B1AYB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Mbd5B1AYB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Mbd5B1AYB6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Mbd5B1AYB6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Mbd5B1AYB6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Mbd5B1AYB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Mbd5B1AYB6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Mbd5B1AYB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Mbd5B1AYB6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Mbd5B1AYB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Mbd5B1AYB6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Mbd5B1AYB6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Mbd5B1AYB6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Mbd5B1AYB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Mbd5B1AYB6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Mbd5B1AYB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Mbd5B1AYB6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Mbd5B1AYB6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Mbd5B1AYB6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Mbd5B1AYB6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Mbd5B1AYB6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Mbd5B1AYB6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Mbd5B1AYB6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Mbd5B1AYB6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Mbd5B1AYB6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Mbd5B1AYB6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Mbd5B1AYB6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Mbd5B1AYB6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Mbd5B1AYB6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Mbd5B1AYB6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Mbd5B1AYB6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Mbd5B1AYB6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Mbd5B1AYB6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Mbd5B1AYB6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Mbd5B1AYB6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Mbd5B1AYB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Mbd5B1AYB6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Mbd5B1AYB6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Mbd5B1AYB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Mbd5B1AYB6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Mbd5B1AYB6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Mbd5B1AYB6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Mbd5B1AYB6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Mbd5B1AYB6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Mbd5B1AYB6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Mbd5B1AYB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Mbd5B1AYB6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Mbd5B1AYB6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Mbd5B1AYB6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Mbd5B1AYB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Mbd5B1AYB6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Mbd5B1AYB6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Mbd5B1AYB6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Mbd5B1AYB6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Mbd5B1AYB6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Mbd5B1AYB6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Mbd5B1AYB6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Mbd5B1AYB6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Mbd5B1AYB6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Mbd5B1AYB6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Mbd5B1AYB6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Mbd5B1AYB6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Mbd5B1AYB6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Mbd5B1AYB6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Mbd5B1AYB6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms