Protein–RNA interactions for Protein: B1AVY7

Kif16b, Kinesin-like protein KIF16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif16bB1AVY7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kif16bB1AVY7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Kif16bB1AVY7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kif16bB1AVY7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Kif16bB1AVY7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kif16bB1AVY7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Kif16bB1AVY7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Kif16bB1AVY7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Kif16bB1AVY7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Kif16bB1AVY7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kif16bB1AVY7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Kif16bB1AVY7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
Kif16bB1AVY7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Kif16bB1AVY7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Kif16bB1AVY7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kif16bB1AVY7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Kif16bB1AVY7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Kif16bB1AVY7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kif16bB1AVY7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kif16bB1AVY7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Kif16bB1AVY7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kif16bB1AVY7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kif16bB1AVY7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kif16bB1AVY7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Kif16bB1AVY7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Kif16bB1AVY7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kif16bB1AVY7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kif16bB1AVY7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kif16bB1AVY7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kif16bB1AVY7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kif16bB1AVY7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Kif16bB1AVY7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kif16bB1AVY7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kif16bB1AVY7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kif16bB1AVY7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kif16bB1AVY7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Kif16bB1AVY7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kif16bB1AVY7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Kif16bB1AVY7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Kif16bB1AVY7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Kif16bB1AVY7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kif16bB1AVY7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Kif16bB1AVY7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kif16bB1AVY7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kif16bB1AVY7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kif16bB1AVY7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kif16bB1AVY7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Kif16bB1AVY7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Kif16bB1AVY7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kif16bB1AVY7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kif16bB1AVY7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kif16bB1AVY7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kif16bB1AVY7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kif16bB1AVY7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kif16bB1AVY7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kif16bB1AVY7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kif16bB1AVY7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kif16bB1AVY7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kif16bB1AVY7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Kif16bB1AVY7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Kif16bB1AVY7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kif16bB1AVY7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kif16bB1AVY7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kif16bB1AVY7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kif16bB1AVY7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kif16bB1AVY7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Kif16bB1AVY7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kif16bB1AVY7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kif16bB1AVY7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kif16bB1AVY7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kif16bB1AVY7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kif16bB1AVY7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Kif16bB1AVY7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kif16bB1AVY7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kif16bB1AVY7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kif16bB1AVY7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kif16bB1AVY7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kif16bB1AVY7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Kif16bB1AVY7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kif16bB1AVY7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kif16bB1AVY7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kif16bB1AVY7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kif16bB1AVY7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Kif16bB1AVY7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kif16bB1AVY7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kif16bB1AVY7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Kif16bB1AVY7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kif16bB1AVY7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms