Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Odf2A3KGV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Odf2A3KGV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Odf2A3KGV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Odf2A3KGV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Odf2A3KGV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Odf2A3KGV1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30■■■□□ 2.39
Odf2A3KGV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Odf2A3KGV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Odf2A3KGV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Odf2A3KGV1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Odf2A3KGV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Odf2A3KGV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Odf2A3KGV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Odf2A3KGV1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Odf2A3KGV1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Odf2A3KGV1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Odf2A3KGV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Odf2A3KGV1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Odf2A3KGV1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Odf2A3KGV1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Odf2A3KGV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Odf2A3KGV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Odf2A3KGV1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Odf2A3KGV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Odf2A3KGV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Odf2A3KGV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Odf2A3KGV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Odf2A3KGV1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Odf2A3KGV1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Odf2A3KGV1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Odf2A3KGV1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Odf2A3KGV1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Odf2A3KGV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Odf2A3KGV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Odf2A3KGV1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Odf2A3KGV1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Odf2A3KGV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Odf2A3KGV1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Odf2A3KGV1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Odf2A3KGV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Odf2A3KGV1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Odf2A3KGV1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Odf2A3KGV1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Odf2A3KGV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Odf2A3KGV1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Odf2A3KGV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Odf2A3KGV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Odf2A3KGV1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Odf2A3KGV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Odf2A3KGV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Odf2A3KGV1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Odf2A3KGV1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Odf2A3KGV1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Odf2A3KGV1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Odf2A3KGV1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Odf2A3KGV1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Odf2A3KGV1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Odf2A3KGV1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Odf2A3KGV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Odf2A3KGV1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Odf2A3KGV1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Odf2A3KGV1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Odf2A3KGV1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Odf2A3KGV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Odf2A3KGV1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Odf2A3KGV1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Odf2A3KGV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Odf2A3KGV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Odf2A3KGV1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Odf2A3KGV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Odf2A3KGV1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Odf2A3KGV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Odf2A3KGV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Odf2A3KGV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Odf2A3KGV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms