Protein–RNA interactions for Protein: A2BG94

Gm6890, Predicted gene 6890, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6890A2BG94 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm6890A2BG94 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm6890A2BG94 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm6890A2BG94 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm6890A2BG94 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm6890A2BG94 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm6890A2BG94 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm6890A2BG94 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6890A2BG94 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm6890A2BG94 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm6890A2BG94 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6890A2BG94 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm6890A2BG94 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm6890A2BG94 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm6890A2BG94 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6890A2BG94 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6890A2BG94 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm6890A2BG94 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6890A2BG94 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6890A2BG94 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6890A2BG94 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6890A2BG94 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6890A2BG94 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6890A2BG94 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6890A2BG94 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6890A2BG94 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6890A2BG94 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6890A2BG94 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6890A2BG94 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm6890A2BG94 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm6890A2BG94 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6890A2BG94 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6890A2BG94 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm6890A2BG94 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6890A2BG94 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm6890A2BG94 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6890A2BG94 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm6890A2BG94 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm6890A2BG94 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm6890A2BG94 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm6890A2BG94 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6890A2BG94 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm6890A2BG94 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6890A2BG94 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6890A2BG94 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6890A2BG94 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm6890A2BG94 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6890A2BG94 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6890A2BG94 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm6890A2BG94 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm6890A2BG94 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm6890A2BG94 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6890A2BG94 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6890A2BG94 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6890A2BG94 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6890A2BG94 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm6890A2BG94 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm6890A2BG94 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6890A2BG94 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm6890A2BG94 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm6890A2BG94 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm6890A2BG94 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6890A2BG94 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm6890A2BG94 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6890A2BG94 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6890A2BG94 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6890A2BG94 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm6890A2BG94 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms