Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Sdccag3A2AIW0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Sdccag3A2AIW0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Sdccag3A2AIW0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Sdccag3A2AIW0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Sdccag3A2AIW0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Sdccag3A2AIW0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Sdccag3A2AIW0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Sdccag3A2AIW0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Sdccag3A2AIW0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Sdccag3A2AIW0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Sdccag3A2AIW0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Sdccag3A2AIW0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Sdccag3A2AIW0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Sdccag3A2AIW0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Sdccag3A2AIW0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Sdccag3A2AIW0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Sdccag3A2AIW0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Sdccag3A2AIW0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Sdccag3A2AIW0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Sdccag3A2AIW0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Sdccag3A2AIW0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Sdccag3A2AIW0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Sdccag3A2AIW0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Sdccag3A2AIW0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Sdccag3A2AIW0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Sdccag3A2AIW0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Sdccag3A2AIW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Sdccag3A2AIW0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Sdccag3A2AIW0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Sdccag3A2AIW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Sdccag3A2AIW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Sdccag3A2AIW0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Sdccag3A2AIW0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Sdccag3A2AIW0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Sdccag3A2AIW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Sdccag3A2AIW0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Sdccag3A2AIW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Sdccag3A2AIW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Sdccag3A2AIW0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Sdccag3A2AIW0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Sdccag3A2AIW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Sdccag3A2AIW0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Sdccag3A2AIW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Sdccag3A2AIW0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Sdccag3A2AIW0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Sdccag3A2AIW0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Sdccag3A2AIW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Sdccag3A2AIW0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Sdccag3A2AIW0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Sdccag3A2AIW0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Sdccag3A2AIW0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Sdccag3A2AIW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Sdccag3A2AIW0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Sdccag3A2AIW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Sdccag3A2AIW0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Sdccag3A2AIW0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Sdccag3A2AIW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Sdccag3A2AIW0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Sdccag3A2AIW0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Sdccag3A2AIW0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Sdccag3A2AIW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Sdccag3A2AIW0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Sdccag3A2AIW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Sdccag3A2AIW0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Sdccag3A2AIW0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Sdccag3A2AIW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Sdccag3A2AIW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Sdccag3A2AIW0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Sdccag3A2AIW0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Sdccag3A2AIW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Sdccag3A2AIW0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Sdccag3A2AIW0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Sdccag3A2AIW0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Sdccag3A2AIW0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sdccag3A2AIW0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sdccag3A2AIW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
Sdccag3A2AIW0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sdccag3A2AIW0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Sdccag3A2AIW0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms