Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Krt24A1L317 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Krt24A1L317 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Krt24A1L317 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Krt24A1L317 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Krt24A1L317 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Krt24A1L317 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Krt24A1L317 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Krt24A1L317 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Krt24A1L317 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Krt24A1L317 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Krt24A1L317 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,05■■■□□ 2,88
Krt24A1L317 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Krt24A1L317 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Krt24A1L317 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Krt24A1L317 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Krt24A1L317 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Krt24A1L317 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Krt24A1L317 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Krt24A1L317 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Krt24A1L317 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Krt24A1L317 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Krt24A1L317 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Krt24A1L317 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Krt24A1L317 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
Krt24A1L317 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Krt24A1L317 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Krt24A1L317 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Krt24A1L317 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Krt24A1L317 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Krt24A1L317 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Krt24A1L317 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Krt24A1L317 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Krt24A1L317 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Krt24A1L317 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Krt24A1L317 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Krt24A1L317 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Krt24A1L317 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Krt24A1L317 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Krt24A1L317 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
Krt24A1L317 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Krt24A1L317 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Krt24A1L317 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Krt24A1L317 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Krt24A1L317 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Krt24A1L317 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Krt24A1L317 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Krt24A1L317 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Krt24A1L317 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Krt24A1L317 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Krt24A1L317 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Krt24A1L317 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Krt24A1L317 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Krt24A1L317 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Krt24A1L317 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Krt24A1L317 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Krt24A1L317 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Krt24A1L317 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Krt24A1L317 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Krt24A1L317 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Krt24A1L317 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Krt24A1L317 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Krt24A1L317 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Krt24A1L317 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Krt24A1L317 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Krt24A1L317 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Krt24A1L317 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Krt24A1L317 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Krt24A1L317 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Krt24A1L317 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Krt24A1L317 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Krt24A1L317 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Krt24A1L317 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Krt24A1L317 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Krt24A1L317 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Krt24A1L317 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Krt24A1L317 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Krt24A1L317 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Krt24A1L317 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Krt24A1L317 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms