Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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2210011C24RikA0A087WQ89 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
2210011C24RikA0A087WQ89 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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2210011C24RikA0A087WQ89 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
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2210011C24RikA0A087WQ89 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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2210011C24RikA0A087WQ89 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
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2210011C24RikA0A087WQ89 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms