Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv31A0A075B5J5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv31A0A075B5J5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv31A0A075B5J5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv31A0A075B5J5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv31A0A075B5J5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv31A0A075B5J5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv31A0A075B5J5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv31A0A075B5J5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv31A0A075B5J5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv31A0A075B5J5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv31A0A075B5J5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv31A0A075B5J5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv31A0A075B5J5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv31A0A075B5J5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv31A0A075B5J5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv31A0A075B5J5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv31A0A075B5J5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv31A0A075B5J5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv31A0A075B5J5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv31A0A075B5J5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv31A0A075B5J5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv31A0A075B5J5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv31A0A075B5J5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv31A0A075B5J5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trbv31A0A075B5J5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv31A0A075B5J5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv31A0A075B5J5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv31A0A075B5J5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv31A0A075B5J5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv31A0A075B5J5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv31A0A075B5J5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv31A0A075B5J5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv31A0A075B5J5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv31A0A075B5J5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv31A0A075B5J5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv31A0A075B5J5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trbv31A0A075B5J5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv31A0A075B5J5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv31A0A075B5J5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trbv31A0A075B5J5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trbv31A0A075B5J5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv31A0A075B5J5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv31A0A075B5J5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv31A0A075B5J5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv31A0A075B5J5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv31A0A075B5J5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv31A0A075B5J5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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