Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms