Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCML1Q9UN30 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms