Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNPO2Q9UMS6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNPO2Q9UMS6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms