Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms