Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGO1Q5FBB7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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