Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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