Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKIV2LQ15477 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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